Investigación
Nuestro grupo explora la diversidad microbiana en diferentes ecosistemas de Costa Rica. Con esto, buscamos dilucidar las funciones que los microorganismos desempeñan en el ambiente pero también explorar su potencial para el desarrollo de aplicaciones biotecnológicas.
Búsqueda de moléculas antibióticas en entornos poco explorados
La aparición de microorganismos multirresistentes a los antibióticos comerciales ha sido clasificada por la Organización Mundial de la Salud como una amenaza para la salud pública, cuyas proyecciones son motivo de preocupación para la comunidad científica internacional. Nuestro grupo de investigación, mediante una combinación de técnicas dependientes e independientes de cultivo, busca microorganismos capaces de producir antibióticos en ambientes poco explorados de Costa Rica.
Algunos de nuestros trabajos en este campo de investigación:
Diego Rojas-Gätjens, Katherine J. Valverde-Madrigal, Keilor Rojas-Jimenez, Reinaldo Pereira & Max Chavarría. Antibiotic-producing Micrococcales govern the microbiome that inhabits the fur of two- and three-toed sloths. Environmental Microbiology (2022). https://doi.org/10.1111/1462- 2920.16082.
Diversidad microbiana y potencial biotecnológico en entornos extremos
Al formar parte del Cinturón de Fuego del Pacífico, Costa Rica cuenta con volcanes activos y una gran cantidad de manifestaciones volcánicas tales como ríos ácidos y aguas termales. Estos ambientes extremos poseen diferentes características fisicoquímicas por lo que su estudio es de interés para varias áreas del conocimiento. Nuestro grupo de investigación está interesado en estudiar la diversidad microbiana en estos ambientes extremos y explorar su potencial biotecnológico.
Algunos de nuestros trabajos en este campo de investigación:
Diego Rojas‑Gätjens1, Alejandro Arce‑Rodríguez, Fernando Puente‑Sánchez, Roberto Avendaño, Eduardo Libby, Raúl Mora‑Amador5,6 · Keilor Rojas‑Jimenez, Paola Fuentes‑Schweizer, Dietmar H. Pieper &
Max Chavarría. Temperature and elemental sulfur shape microbial communities in two extremely acidic aquatic volcanic environments. Extremophiles (2021), 25:85–99. https://doi.org/10.1007/s00792-020-01213-w
Alejandro Arce-Rodríguez, Eduardo Libby, Erick Castellón, Roberto Avendaño, Juan Carlos Cambronero, Maribel Vargas, Dietmar H Pieper, Stefan Bertilsson, Max Chavarría, Fernando Puente-Sánchez. Out of the blue: the independent activity of sulfur-oxidizers and diatoms mediate the sudden color shift of a tropical river. Environmental Microbiome (2023) 18, 6. https://doi.org/10.1186/s40793-023-00464-2
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Estudio de la diversidad de hongos entomopatógenos en Costa Rica
Los hongos entomopatógenos representan una herramienta prometedora y ecológica en el control de plagas y la protección de cultivos. Asimismo, debido a su mecanismo de acción, se consideran una fuente novedosa de moléculas bioactivas. Su capacidad única para infectar insectos y artrópodos, junto con su bajo impacto ambiental y su potencial para la agricultura sostenible, los convierten en una opción atractiva en el panorama actual. A medida que avance la investigación y se aborden los retos técnicos y logísticos, es probable que los hongos entomopatógenos desempeñen un papel cada vez más crucial en la promoción de sistemas agrícolas sanos y equilibrados. Sin embargo, antes de proponer aplicaciones potenciales en agricultura o sanidad, es necesario conocer la diversidad de los hongos entomopatógenos y su selectividad por el hospedador o los hospedadores.
Microbiomas asociados a animales de Costa Rica
El conocimiento de la diversidad microbiana asociada a los animales es de interés desde muchos puntos de vista, incluyendo la ecología, la biotecnología y la zoonosis. Nuestro grupo está interesado en conocer los microbiomas asociados a animales de la fauna costarricense y así dilucidar su diversidad y potencial biotecnológico para la producción de enzimas y moléculas bioactivas. Por otra parte, estamos interesados en evaluar la presencia de potenciales enfermedades zoonóticas que puedan ser transmitidas de animales a humanos.
Some of our work in this area of research:
Diego Rojas-Gätjens, Judy Avey-Arroyo, Priscila Chaverri, Keilor Rojas-Jimenez, Max Chavarría. Differences in fungal communities in the fur of two-and three-toed sloths revealed by ITS metabarcoding. Microbiology (2023) 169 (2): 001309. https://doi.org/10.1099/mic.0.001309
